自治区疾控中心新疆医学动物昆虫标本馆自建立以来，以新疆自然疫源性疾病相关宿主动物、昆虫标本为主，收藏近4万件医学动物昆虫标本，其中啮齿动物75种、蚤类210余种、蜱类42种、螨类标本92种、蚊类32种、鸟类70种，是目前全区标本数量最多、物种最丰富的动物昆虫标本馆，对于开展科学研究、宣传自然疫源性疾病、普及动物医学知识有着重要意义医学。

　　2022年9月自治区疾控中心新疆医学动物昆虫标本馆被认定为第一批自治区科普教育基地。基于对动物标本的展示，对鼠疫流行的溯源，以及对传染病知识的传递，自治区疾控中心新疆医学动物昆虫标本馆为公众呈现出有科普教育意义的平台。